Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli2Q0VGT2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli2Q0VGT2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms