Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms