Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrioQ0KL02 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms