Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gata4Q08369 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms