Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou6f1Q07916 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms