Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nfe2Q07279 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms