Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdr16c6Q05A13 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms