Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fmn1Q05860 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms