Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sox12Q04890 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms