Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CkbQ04447 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms