Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff2Q03404 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms