Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1sQ02789 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1sQ02789 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms