Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pax5Q02650 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pax5Q02650 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms