Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms