Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms