Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms