Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms