Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms