Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PrcdQ00LT2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms