Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms