Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms