Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F8a1Q00558 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F8a1Q00558 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms