Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx2Q00262 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms