Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AlkP97793 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
AlkP97793 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AlkP97793 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AlkP97793 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AlkP97793 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AlkP97793 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms