Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cited1P97769 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cited1P97769 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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