Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tarbp2P97473 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tarbp2P97473 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms