Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps45P97390 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms