Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms