Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tubg1P83887 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms