Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cux2P70298 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms