Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad54lP70270 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms