Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Pkn1P70268 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Pkn1P70268 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkn1P70268 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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