Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plxna3P70208 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms