Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms