Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn5P68500 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms