Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms