Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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