Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps3P62908 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms