Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd1P62315 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms