Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp46P62069 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms