Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms