Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ActbP60710 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ActbP60710 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ActbP60710 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms