Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdo1P60334 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdo1P60334 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdo1P60334 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdo1P60334 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdo1P60334 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdo1P60334 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms