Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3bP59470 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms