Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hps5P59438 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms