Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrnp1P59054 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrnp1P59054 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms