Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms