Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smpdl3bP58242 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpdl3bP58242 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms