Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms