Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bace1P56818 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bace1P56818 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms